Já mencionei aqui como excluir os valores missing dos seus cálculos no R, e aqui explico como excluir as linhas contendo valores missing. Porém, como vocês bem sabem, ao excluirmos a linha inteira temos perda de informação, afinal, uma coluna pode estar missing mas todo o restante da linha conter informação. Sendo assim, alguns estatísticos podem preferir não excluir a linha e fazer a escolha de substituir esses missing por outro valor, aqui vamos substituir pela média: